10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_B0030 on replicon NC_010157
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010157  YpAngola_B0030  translocator protein YopB  100 
 
 		 401 aa  802    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.556106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42450  translocator protein PopB  43.14 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01741  hypothetical protein  36.46 
 
 		 399 aa  190  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003377  type III secretion host injection protein (YopB)  36.63 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5050  EspD  27.6 
 
 		 374 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1773  translocation machinery component  26.96 
 
 		 484 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1511  translocation machinery component  29.89 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.119041 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1496  translocation machinery component  29.89 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.947736 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1533  translocation machinery component  29.89 
 
 		 484 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12844 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1943  translocation machinery component  29.89 
 
 		 484 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.319033  normal  0.78715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>