13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1311 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1311  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  483  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4481  protein of unknown function DUF434  49.57 
 
 
266 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5613  protein of unknown function DUF434  39.01 
 
 
249 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.787804  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2048  hypothetical protein  32 
 
 
237 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000587304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0109  hypothetical protein  30.99 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0553  hypothetical protein  31.25 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.897121  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0220  hypothetical protein  28.64 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1639  hypothetical protein  28.5 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1457  hypothetical protein  23 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0742  hypothetical protein  23.28 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1213  hypothetical protein  22.38 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.946455 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1312  protein of unknown function DUF434  21.05 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3193  hypothetical protein  21.23 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0089473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>