12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5613 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5613  protein of unknown function DUF434  100 
 
 		 249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.787804  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1311  hypothetical protein  39.01 
 
 		 242 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4481  protein of unknown function DUF434  36 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2048  hypothetical protein  32.33 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000587304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0109  hypothetical protein  30.58 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0220  hypothetical protein  26.94 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0553  hypothetical protein  22.98 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.897121  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0742  hypothetical protein  23.81 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3193  hypothetical protein  22.89 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0089473 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1457  hypothetical protein  22.96 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1213  hypothetical protein  23.65 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.946455 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1639  hypothetical protein  30.05 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>