15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_19323 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_19323  predicted protein  100 
 
 
442 aa  912    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158987  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04783  COP9 signalosome complex subunit 2 (Signalosome subunit 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B3U7]  45.95 
 
 
506 aa  411  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.371284  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01880  endopeptidase, putative  47.1 
 
 
479 aa  371  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28818  COP9 SigNalosome subunit 2  41.69 
 
 
404 aa  301  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000148677  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59093  predicted protein  27.36 
 
 
416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0602507 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89414  predicted protein  22.75 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.607018 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00870  endopeptidase, putative  21.64 
 
 
423 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36468  predicted protein  23.66 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.636278  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_52198  regulatory proteasome non-atpase subunit 6  23.5 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39898  predicted protein  25 
 
 
445 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10519  proteasome regulatory particle subunit (RpnF), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06300)  21.07 
 
 
424 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30935  predicted protein  24.3 
 
 
445 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.403513  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00700  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit 6, putative  31.9 
 
 
463 aa  43.9  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0896667  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27220  predicted protein  26.53 
 
 
420 aa  43.1  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.308313  normal  0.152217 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29689  predicted protein  26.53 
 
 
420 aa  43.1  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0208694  hitchhiker  0.00156333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>