18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2991 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2991  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  230  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.310456  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1089  hypothetical protein  84.04 
 
 
94 aa  157  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2219  hypothetical protein  70.59 
 
 
63 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0008  hypothetical protein  58.82 
 
 
92 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.791262  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0739  hypothetical protein  59.18 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3019  hypothetical protein  54.84 
 
 
64 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189985  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3615  hypothetical protein  46.43 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576626  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0011  hypothetical protein  52.46 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894998  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3492  hypothetical protein  46.43 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.176609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5112  hypothetical protein  49.15 
 
 
65 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0173  hypothetical protein  39.39 
 
 
117 aa  50.4  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3292  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307693  normal  0.843731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3278  hypothetical protein  58.54 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3220  hypothetical protein  45 
 
 
63 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.318816  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1615  hypothetical protein  50.98 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1035  hypothetical protein  50.98 
 
 
66 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4508  hypothetical protein  48.72 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1708  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.118644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>