15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3220 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3220  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.318816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1615  hypothetical protein  87.3 
 
 		 63 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1035  hypothetical protein  82.26 
 
 		 66 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2421  hypothetical protein  71.43 
 
 		 73 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0008  hypothetical protein  55.17 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.791262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0739  hypothetical protein  54.39 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0011  hypothetical protein  58.49 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894998  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0173  hypothetical protein  48.28 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2219  hypothetical protein  51.85 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2991  hypothetical protein  45 
 
 		 114 aa  48.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.310456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3019  hypothetical protein  45.9 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189985  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1089  hypothetical protein  45.28 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3278  hypothetical protein  53.66 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1708  hypothetical protein  45.28 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.118644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5112  hypothetical protein  40.68 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>