15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1615 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1615  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3220  hypothetical protein  87.3 
 
 		 63 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.318816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1035  hypothetical protein  79.03 
 
 		 66 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2421  hypothetical protein  74.07 
 
 		 73 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0011  hypothetical protein  60.38 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894998  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0173  hypothetical protein  51.67 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0739  hypothetical protein  56.36 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0008  hypothetical protein  57.41 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.791262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2219  hypothetical protein  53.7 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1708  hypothetical protein  46.15 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.118644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2991  hypothetical protein  50.98 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.310456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1089  hypothetical protein  47.17 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3019  hypothetical protein  45.9 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189985  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3278  hypothetical protein  53.66 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5112  hypothetical protein  41.27 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>