14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0008 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0008  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.791262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0739  hypothetical protein  86.96 
 
 		 74 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0011  hypothetical protein  75.38 
 
 		 69 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894998  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1035  hypothetical protein  55.74 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2991  hypothetical protein  58.82 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.310456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3220  hypothetical protein  55.17 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.318816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2219  hypothetical protein  57.41 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1615  hypothetical protein  57.41 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1089  hypothetical protein  51.92 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3019  hypothetical protein  56.6 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189985  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5112  hypothetical protein  49.18 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0173  hypothetical protein  45.28 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3278  hypothetical protein  52.5 
 
 		 67 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2421  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>