22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4274 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4274  hypothetical protein  100 
 
 
570 aa  1109    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.813876  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1321  putative integral membrane protein  55.91 
 
 
515 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1817  IT superfamily transporter  47.64 
 
 
552 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115565  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2015  hypothetical protein  46.74 
 
 
527 aa  445  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4354  hypothetical protein  45.84 
 
 
509 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3760  hypothetical protein  47.54 
 
 
515 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3635  putative transporter  46.29 
 
 
512 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1644  hypothetical protein  38.79 
 
 
453 aa  148  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.88743 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1464  hypothetical protein  38.39 
 
 
466 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0648  hypothetical protein  37.91 
 
 
466 aa  144  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3925  hypothetical protein  34.31 
 
 
462 aa  140  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3978  hypothetical protein  32.39 
 
 
461 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3928  hypothetical protein  37.02 
 
 
461 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3639  hypothetical protein  39.77 
 
 
461 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1263  hypothetical protein  36.54 
 
 
461 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3894  hypothetical protein  38.83 
 
 
461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000127702 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3621  hypothetical protein  38.83 
 
 
461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3730  hypothetical protein  39.2 
 
 
461 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4018  hypothetical protein  39.2 
 
 
461 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3063  hypothetical protein  32.67 
 
 
453 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000134828  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1411  hypothetical protein  30.5 
 
 
451 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0840459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3703  hypothetical protein  31.25 
 
 
130 aa  43.9  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>