21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1817 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1817  IT superfamily transporter  100 
 
 
552 aa  1076    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115565  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2015  hypothetical protein  78.68 
 
 
527 aa  781    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4354  hypothetical protein  58.53 
 
 
509 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3760  hypothetical protein  58.41 
 
 
515 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3635  putative transporter  57.95 
 
 
512 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1321  putative integral membrane protein  50 
 
 
515 aa  458  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4274  hypothetical protein  46.42 
 
 
570 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.813876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1263  hypothetical protein  30.38 
 
 
461 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3925  hypothetical protein  30.96 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3978  hypothetical protein  30.19 
 
 
461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3639  hypothetical protein  30 
 
 
461 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0648  hypothetical protein  31.86 
 
 
466 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3621  hypothetical protein  30.19 
 
 
461 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3894  hypothetical protein  30.19 
 
 
461 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000127702 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3730  hypothetical protein  29.81 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4018  hypothetical protein  29.81 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1464  hypothetical protein  29.94 
 
 
466 aa  193  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1411  hypothetical protein  27.91 
 
 
451 aa  187  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0840459  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1644  hypothetical protein  43.9 
 
 
453 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.88743 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3928  hypothetical protein  34.48 
 
 
461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3063  hypothetical protein  33.33 
 
 
453 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000134828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>