21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4354 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4354  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  989    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3760  hypothetical protein  70.45 
 
 		 515 aa  618  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3635  putative transporter  70.08 
 
 		 512 aa  617  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1817  IT superfamily transporter  58.53 
 
 		 552 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115565  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2015  hypothetical protein  56.82 
 
 		 527 aa  525  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1321  putative integral membrane protein  51.65 
 
 		 515 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1644  hypothetical protein  34.34 
 
 		 453 aa  266  7e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.88743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4274  hypothetical protein  56.42 
 
 		 570 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.813876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1464  hypothetical protein  32.26 
 
 		 466 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3978  hypothetical protein  31.05 
 
 		 461 aa  204  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3925  hypothetical protein  31.05 
 
 		 462 aa  204  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0648  hypothetical protein  32.53 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1263  hypothetical protein  31.65 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3928  hypothetical protein  31.05 
 
 		 461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3639  hypothetical protein  31.85 
 
 		 461 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3621  hypothetical protein  30.44 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3894  hypothetical protein  30.44 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000127702 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4018  hypothetical protein  31.45 
 
 		 461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3730  hypothetical protein  31.45 
 
 		 461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36576  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1411  hypothetical protein  28.32 
 
 		 451 aa  180  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0840459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3063  hypothetical protein  27.17 
 
 		 453 aa  160  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000134828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>