14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2025 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2025  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0955  hypothetical protein  50.43 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.494066 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12053  hypothetical protein  46.46 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9124  hypothetical protein  42.41 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3978  hypothetical protein  51.11 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0463  hypothetical protein  43.36 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5393  hypothetical protein  33.47 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3249  hypothetical protein  26.25 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000723413  normal  0.230465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3199  hypothetical protein  25.99 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000115841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2092  hypothetical protein  26.32 
 
 		 231 aa  62  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0930  hypothetical protein  30.27 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1093  hypothetical protein  27.85 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1189  hypothetical protein  25.26 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8602  hypothetical protein  24.76 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>