14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8602 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8602  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  486  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2092  hypothetical protein  41.44 
 
 
231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0930  hypothetical protein  40.09 
 
 
230 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1189  hypothetical protein  30.6 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12053  hypothetical protein  28.51 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3249  hypothetical protein  27.62 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000723413  normal  0.230465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3199  hypothetical protein  27.16 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000115841  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0955  hypothetical protein  28.18 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.494066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2025  hypothetical protein  24.76 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0463  hypothetical protein  25.52 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3978  hypothetical protein  24.57 
 
 
249 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1093  hypothetical protein  22.77 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5393  hypothetical protein  25.27 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9124  hypothetical protein  21.53 
 
 
241 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>