15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0660 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0660  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0270  hypothetical protein  58.95 
 
 
99 aa  110  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.154273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2647  hypothetical protein  56.86 
 
 
103 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.601256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0231  hypothetical protein  54.74 
 
 
99 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2224  hypothetical protein  53.54 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000608293  normal  0.302453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0773  hypothetical protein  46.88 
 
 
97 aa  83.6  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3137  Domain of unknown function DUF1905  53.12 
 
 
98 aa  82  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.438812  hitchhiker  0.000153931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2479  hypothetical protein  40.4 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1447  hypothetical protein  38.95 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2209  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1608  hypothetical protein  43.75 
 
 
80 aa  60.1  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.676754  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2840  hypothetical protein  39.36 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0152  Domain of unknown function DUF1905  35.42 
 
 
101 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674001  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4116  hypothetical protein  34.88 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.862862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0300  Domain of unknown function DUF1905  41.18 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>