14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1608 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1608  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  159  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.676754  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2479  hypothetical protein  51.25 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1447  hypothetical protein  46.84 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0231  hypothetical protein  50.88 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0270  hypothetical protein  50.88 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.154273 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0773  hypothetical protein  58.18 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0660  hypothetical protein  43.75 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2647  hypothetical protein  46.25 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.601256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2224  hypothetical protein  57.14 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000608293  normal  0.302453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3137  Domain of unknown function DUF1905  50.91 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.438812  hitchhiker  0.000153931 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0152  Domain of unknown function DUF1905  54.55 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674001  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2840  hypothetical protein  41.82 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2209  hypothetical protein  38.18 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0022  hypothetical protein  44.68 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.0215122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>