15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0300 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0300  Domain of unknown function DUF1905  100 
 
 
151 aa  297  4e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4116  hypothetical protein  58.23 
 
 
101 aa  103  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.862862 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0152  Domain of unknown function DUF1905  53.93 
 
 
101 aa  100  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674001  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2209  hypothetical protein  46.24 
 
 
95 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2840  hypothetical protein  48.31 
 
 
101 aa  92.8  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0022  hypothetical protein  47.06 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.0215122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2479  hypothetical protein  35.8 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0660  hypothetical protein  41.1 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2647  hypothetical protein  30.77 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.601256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0270  hypothetical protein  34.41 
 
 
99 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.154273 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1608  hypothetical protein  45.28 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.676754  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0231  hypothetical protein  32.32 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0773  hypothetical protein  32.98 
 
 
97 aa  42.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1447  hypothetical protein  32.26 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3137  Domain of unknown function DUF1905  31.82 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.438812  hitchhiker  0.000153931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>