16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4116 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4116  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  202  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.862862 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0152  Domain of unknown function DUF1905  59.14 
 
 
101 aa  117  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674001  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2840  hypothetical protein  58.06 
 
 
101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0300  Domain of unknown function DUF1905  57.14 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2209  hypothetical protein  49.46 
 
 
95 aa  107  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0022  hypothetical protein  50.55 
 
 
99 aa  90.9  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.0215122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2479  hypothetical protein  45.68 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2647  hypothetical protein  39 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.601256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0270  hypothetical protein  35.48 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.154273 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0773  hypothetical protein  39.36 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0231  hypothetical protein  34.74 
 
 
99 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0660  hypothetical protein  33 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2224  hypothetical protein  37.89 
 
 
103 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000608293  normal  0.302453 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1447  hypothetical protein  44.44 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1608  hypothetical protein  43.64 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.676754  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3137  Domain of unknown function DUF1905  39.19 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.438812  hitchhiker  0.000153931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>