24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0652 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0652  hypothetical protein  100 
 
 
43 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2738  hypothetical protein  56.76 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0877362  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0172  hypothetical protein  55.26 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2511  hypothetical protein  52.5 
 
 
134 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00847737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2023  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0623  hypothetical protein  48.72 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3084  hypothetical protein  48.72 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5872  hypothetical protein  46.34 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0817748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3104  hypothetical protein  48.72 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412887  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3144  hypothetical protein  48.72 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193303  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5388  hypothetical protein  51.28 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11590  hypothetical protein  47.62 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.30585e-85  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0885  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0978  hypothetical protein  47.5 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1480  hypothetical protein  51.35 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2798  hypothetical protein  47.37 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00699009  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  46.34 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  46.34 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  46.34 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2106  hypothetical protein  45 
 
 
177 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.334754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0997  hypothetical protein  44.44 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0257  hypothetical protein  50 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1090  hypothetical protein  45 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4640  hypothetical protein  42.5 
 
 
143 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>