23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0171 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0171  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  274  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2106  hypothetical protein  49.32 
 
 
183 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.203032 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5269  hypothetical protein  56.16 
 
 
397 aa  84.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0120  hypothetical protein  58.9 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0140  hypothetical protein  56.16 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2401  hypothetical protein  35.71 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3316  hypothetical protein  41.11 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2379  hypothetical protein  31.37 
 
 
169 aa  77  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01670  hypothetical protein  48.65 
 
 
515 aa  76.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.405455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0009  hypothetical protein  42.21 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3933  hypothetical protein  33.93 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0769  hypothetical protein  38.46 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2692  hypothetical protein  46.58 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000209421  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2938  hypothetical protein  46.27 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2986  hypothetical protein  38.04 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0635968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2664  hypothetical protein  38.04 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2750  hypothetical protein  32.11 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4951  hypothetical protein  33.67 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000761257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2143  hypothetical protein  31.37 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.583441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2510  hypothetical protein  39.53 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1725  hypothetical protein  27.63 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2225  hypothetical protein  43.24 
 
 
158 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0009  hypothetical protein  34.21 
 
 
176 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>