23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2379 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2379  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  332  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0009  hypothetical protein  64.39 
 
 
176 aa  168  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2986  hypothetical protein  40 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0635968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2664  hypothetical protein  40.25 
 
 
165 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2401  hypothetical protein  46.38 
 
 
167 aa  114  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2750  hypothetical protein  44.17 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2106  hypothetical protein  35.1 
 
 
183 aa  101  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.203032 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3933  hypothetical protein  35.54 
 
 
170 aa  98.6  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2692  hypothetical protein  34.59 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000209421  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3316  hypothetical protein  40.46 
 
 
167 aa  91.3  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0769  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  90.9  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2938  hypothetical protein  31.01 
 
 
174 aa  90.9  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4951  hypothetical protein  36.13 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000761257  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2510  hypothetical protein  27.33 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1725  hypothetical protein  33.12 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2143  hypothetical protein  28.03 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.583441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0171  hypothetical protein  46.27 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2225  hypothetical protein  35.19 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01670  hypothetical protein  33.73 
 
 
515 aa  60.5  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.405455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0140  hypothetical protein  33.78 
 
 
138 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0009  hypothetical protein  37.35 
 
 
178 aa  57.4  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0120  hypothetical protein  35.23 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5269  hypothetical protein  40 
 
 
397 aa  48.5  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>