27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01670 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_01670  hypothetical protein  100 
 
 
515 aa  996    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.405455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2106  hypothetical protein  54.32 
 
 
183 aa  91.3  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.203032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0140  hypothetical protein  49.32 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0171  hypothetical protein  56.06 
 
 
142 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0120  hypothetical protein  43.01 
 
 
151 aa  77.8  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2510  hypothetical protein  41 
 
 
172 aa  75.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2143  hypothetical protein  43.18 
 
 
163 aa  75.5  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.583441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2692  hypothetical protein  33.76 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000209421  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5269  hypothetical protein  47.95 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2379  hypothetical protein  34.38 
 
 
169 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2938  hypothetical protein  41.49 
 
 
174 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4951  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000761257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0009  hypothetical protein  39.64 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2401  hypothetical protein  37.08 
 
 
167 aa  71.2  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2750  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2986  hypothetical protein  37.86 
 
 
165 aa  67  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0635968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2664  hypothetical protein  37.86 
 
 
165 aa  67  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0009  hypothetical protein  31.25 
 
 
176 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2225  hypothetical protein  37.14 
 
 
158 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3316  hypothetical protein  36.08 
 
 
167 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0769  hypothetical protein  46.03 
 
 
167 aa  60.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3933  hypothetical protein  31.58 
 
 
170 aa  60.1  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1725  hypothetical protein  26.4 
 
 
155 aa  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  21.86 
 
 
1191 aa  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1219  hypothetical protein  26.83 
 
 
567 aa  45.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000368049 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  25.74 
 
 
403 aa  45.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  25.74 
 
 
403 aa  45.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>