20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5269 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5269  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  738    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0120  hypothetical protein  54.17 
 
 
151 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0140  hypothetical protein  53.64 
 
 
138 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2106  hypothetical protein  51.69 
 
 
183 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.203032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0171  hypothetical protein  57.81 
 
 
142 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0769  hypothetical protein  49.15 
 
 
167 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01670  hypothetical protein  48.39 
 
 
515 aa  65.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.405455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4951  hypothetical protein  55.36 
 
 
166 aa  62.8  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000761257  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2938  hypothetical protein  46.27 
 
 
174 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3933  hypothetical protein  40.58 
 
 
170 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0009  hypothetical protein  49.25 
 
 
178 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3316  hypothetical protein  38.46 
 
 
167 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2401  hypothetical protein  35.62 
 
 
167 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2664  hypothetical protein  42.86 
 
 
165 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2692  hypothetical protein  40 
 
 
176 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000209421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2379  hypothetical protein  40 
 
 
169 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2986  hypothetical protein  42.86 
 
 
165 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0635968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2143  hypothetical protein  38.37 
 
 
163 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.583441  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1725  hypothetical protein  38.18 
 
 
155 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2750  hypothetical protein  36.99 
 
 
170 aa  43.1  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>