14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1098 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1098  phosphoesterase DHHA1  100 
 
 
380 aa  771    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0016  hypothetical protein  24.55 
 
 
325 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.054001  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0862  phosphoesterase, DHHA1  26.95 
 
 
321 aa  96.7  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1398  phosphoesterase, DHHA1  25.47 
 
 
311 aa  93.6  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1865  phosphoesterase DHHA1  26.02 
 
 
311 aa  93.6  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.955345  normal  0.780671 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1526  DHH superfamily phosphohydrolase  24.52 
 
 
323 aa  56.6  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.390938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0259  phosphoesterase DHHA1  25.17 
 
 
329 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1518  phosphoesterase, DHHA1  22.77 
 
 
312 aa  53.5  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  50 
 
 
420 aa  53.5  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07860  phosphoesterase RecJ domain protein  30.38 
 
 
324 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.18 
 
 
466 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  31.03 
 
 
431 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  29.2 
 
 
461 aa  43.9  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  30.43 
 
 
432 aa  43.1  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>