21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0395 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0395  prefoldin subunit alpha  100 
 
 
145 aa  291  1e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0549936 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1966  prefoldin, alpha subunit  43.48 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3021  prefoldin alpha subunit  32.28 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0461  prefoldin subunit alpha  28.89 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.735379  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0542  prefoldin, alpha subunit  28.46 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000518948  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0871  prefoldin, alpha subunit  27.59 
 
 
157 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1477  hypothetical protein  30.5 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000022612  hitchhiker  0.000493368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1879  prefoldin, alpha subunit  38.75 
 
 
180 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0986301 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0111  prefoldin subunit alpha  27.73 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.162217  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0430  prefoldin, alpha subunit  29.59 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1364  prefoldin subunit alpha  27.54 
 
 
144 aa  47  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1660  prefoldin subunit alpha  26.47 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01205  prefoldin subunit 5, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10740)  25.96 
 
 
173 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0207761  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0780  prefoldin subunit alpha  33.73 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.428943  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15712  predicted protein  35.48 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0715  prefoldin subunit alpha  29.7 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.347569 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1203  prefoldin subunit alpha  33.33 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14629  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0108  prefoldin subunit alpha  31.88 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0756158  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11402  predicted protein  27.48 
 
 
149 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02390  hypothetical protein  23.39 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0460  prefoldin subunit alpha  27.45 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>