21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0108 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0108  prefoldin subunit alpha  100 
 
 		 144 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0756158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1203  prefoldin subunit alpha  91.67 
 
 		 144 aa  265  1e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14629  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0715  prefoldin subunit alpha  88.89 
 
 		 144 aa  257  4e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.347569 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0780  prefoldin subunit alpha  77.94 
 
 		 146 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.428943  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1364  prefoldin subunit alpha  49.62 
 
 		 144 aa  140  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0111  prefoldin subunit alpha  28.7 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.162217  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0430  prefoldin, alpha subunit  33.02 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3021  prefoldin alpha subunit  26.81 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1966  prefoldin, alpha subunit  26.28 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1477  hypothetical protein  29.55 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000022612  hitchhiker  0.000493368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0461  prefoldin subunit alpha  28.91 
 
 		 144 aa  48.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.735379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0542  prefoldin, alpha subunit  26.67 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000518948  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1258  prefoldin, alpha subunit  26.06 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0822  prefoldin, alpha subunit  26.32 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.777251  normal  0.974063 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0238  prefoldin, alpha subunit  28.05 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1329  prefoldin, alpha subunit  29.11 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0395  prefoldin subunit alpha  31.88 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0549936 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1565  prefoldin subunit alpha  25.41 
 
 		 153 aa  42  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1230  prefoldin, alpha subunit  23.4 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1816  prefoldin, alpha subunit  24.71 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1879  prefoldin, alpha subunit  31.33 
 
 		 180 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0986301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>