20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_R0002 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_R0059  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.326972  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.227888  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0022  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0062  tRNA-Ala  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0033  tRNA-Ala  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0016  tRNA-Ala  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0030  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00218257  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0016  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0002  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00133313  normal  0.0937878 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_R0059  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0044  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0031  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0021  tRNA-Ala  87.3 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0028  tRNA-Ala  87.3 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0023  tRNA-Ala  87.3 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0033  tRNA-Ala  87.3 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177438  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_265  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0005  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>