18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2934 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2934  putative 2-component system sensor kinase  100 
 
 
235 aa  449  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0697  hypothetical protein  33.02 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.73017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1928  hypothetical protein  32.04 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0924  sensor protein  27.35 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0782593  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2609  putative 2-component system sensor kinase  30.89 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00425564  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2800  putative 2-component system sensor kinase  29.86 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428879  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0893  hypothetical protein  24.66 
 
 
294 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  31.67 
 
 
442 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
492 aa  52  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0406  hypothetical protein  31.25 
 
 
269 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2027  hypothetical protein  22.16 
 
 
192 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3227  hypothetical protein  22.67 
 
 
192 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.256494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
418 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
417 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2995  hypothetical protein  22.73 
 
 
192 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.621881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  28.69 
 
 
446 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  32.11 
 
 
433 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
564 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>