14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2609 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2609  putative 2-component system sensor kinase  100 
 
 
251 aa  486  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00425564  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0406  hypothetical protein  37.23 
 
 
269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2800  putative 2-component system sensor kinase  40.47 
 
 
251 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428879  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0697  hypothetical protein  35.06 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.73017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0924  sensor protein  32.91 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0782593  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2934  putative 2-component system sensor kinase  31.71 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1928  hypothetical protein  32.45 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  31.18 
 
 
442 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2995  hypothetical protein  22.79 
 
 
192 aa  52.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.621881  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1245  hypothetical protein  31.4 
 
 
329 aa  52  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256139  normal  0.208898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  28.86 
 
 
446 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3227  hypothetical protein  22.07 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.256494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2027  hypothetical protein  22.22 
 
 
192 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.85 
 
 
415 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>