12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1450 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1450    100 
 
 
1971 bp  3907    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3042  transposase IS4 family protein  82.78 
 
 
999 bp  186  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3050  transposase IS4 family protein  82.78 
 
 
999 bp  186  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3144  transposase IS4 family protein  82.78 
 
 
939 bp  186  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3190    82.78 
 
 
879 bp  186  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0921  transposase IS4 family protein  82.78 
 
 
999 bp  186  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000594027 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1212  transposase IS4 family protein  82.78 
 
 
999 bp  186  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000262262  hitchhiker  0.00000730642 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3282  transposase IS4 family protein  82.78 
 
 
999 bp  186  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3405  transposase IS4 family protein  82.78 
 
 
999 bp  186  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3417  transposase IS4 family protein  82.78 
 
 
999 bp  186  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4642  hypothetical protein  82.22 
 
 
201 bp  52  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3246    93.75 
 
 
206 bp  48.1  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.837318  normal  0.237088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>