11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3190 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3042  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 999 bp  1742    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3050  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 999 bp  1742    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3144  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 939 bp  1742    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3190    100 
 
 		 879 bp  1742    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0921  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 999 bp  1742    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000594027 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1212  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 999 bp  1742    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000262262  hitchhiker  0.00000730642 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3282  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 999 bp  1742    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3405  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 999 bp  1742    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3417  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 999 bp  1742    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1450    82.78 
 
 		 1971 bp  186  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3246    93.83 
 
 		 206 bp  121  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.837318  normal  0.237088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>