11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3417 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_3042  transposase IS4 family protein  100 
 
 
332 aa  688    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3050  transposase IS4 family protein  100 
 
 
332 aa  688    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3144  transposase IS4 family protein  100 
 
 
312 aa  649    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0921  transposase IS4 family protein  100 
 
 
332 aa  688    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000594027 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1212  transposase IS4 family protein  100 
 
 
332 aa  688    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000262262  hitchhiker  0.00000730642 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3282  transposase IS4 family protein  100 
 
 
332 aa  688    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3405  transposase IS4 family protein  100 
 
 
332 aa  688    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3417  transposase IS4 family protein  100 
 
 
332 aa  688    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0879  transposase IS4 family protein  24.71 
 
 
296 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1517  transposase IS4 family protein  24.71 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1673  transposase IS4 family protein  24.71 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>