16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1261 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0982    85.13 
 
 
1113 bp  660    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2840  transposase, IS605 OrfB family  87.17 
 
 
1242 bp  654    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249005  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1261    100 
 
 
888 bp  1760    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0939273  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2571  transposase, IS605 OrfB family  86.58 
 
 
1242 bp  622  1e-176  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3190  transposase, IS605 OrfB family  83.54 
 
 
1290 bp  264  4e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3051  transposase, IS605 OrfB family  88.69 
 
 
1299 bp  182  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3927  transposase, IS605 OrfB family  82.13 
 
 
1230 bp  149  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.770218  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2314  transposase, IS605 OrfB family  80.17 
 
 
1260 bp  109  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0812  transposase, IS605 OrfB family  91.78 
 
 
1257 bp  97.6  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3397  transposase, IS605 OrfB family  82.52 
 
 
1224 bp  85.7  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2509  transposase, IS605 OrfB family  97.14 
 
 
1266 bp  61.9  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3284    91.3 
 
 
171 bp  60  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0315896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2202  transposase, IS605 OrfB family  79.49 
 
 
1254 bp  56  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2852    84.72 
 
 
1271 bp  56  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4384    100 
 
 
1243 bp  52  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0429701  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1481  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  100 
 
 
2073 bp  48.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>