11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4384 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4384    100 
 
 
1243 bp  2464    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0429701  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2509  transposase, IS605 OrfB family  82.06 
 
 
1266 bp  613  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2680  transposase, IS605 OrfB family  80.84 
 
 
1242 bp  551  1e-154  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430379  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2347    81.86 
 
 
1298 bp  375  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0812  transposase, IS605 OrfB family  82.4 
 
 
1257 bp  357  5e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3846    82.46 
 
 
228 bp  125  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.134225  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2571  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 
1242 bp  52  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1261    100 
 
 
888 bp  52  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0939273  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3051  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 
1299 bp  48.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3397  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 
1224 bp  48.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3927  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 
1230 bp  48.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.770218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>