10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0982 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0982    100 
 
 
1113 bp  2206    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2571  transposase, IS605 OrfB family  89.32 
 
 
1242 bp  1031    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2840  transposase, IS605 OrfB family  87.67 
 
 
1242 bp  912    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249005  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1261    85.13 
 
 
888 bp  660    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0939273  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3190  transposase, IS605 OrfB family  83.46 
 
 
1290 bp  244  5e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3397  transposase, IS605 OrfB family  88.06 
 
 
1224 bp  139  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3051  transposase, IS605 OrfB family  86 
 
 
1299 bp  131  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3927  transposase, IS605 OrfB family  92.96 
 
 
1230 bp  101  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.770218  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3284    87.21 
 
 
171 bp  83.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0315896 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2314  transposase, IS605 OrfB family  86.36 
 
 
1260 bp  79.8  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>