32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0428 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0428  RNA polymerase Rpb6  100 
 
 		 58 aa  120  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2546  RNA polymerase Rpb6  87.72 
 
 		 61 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1824  RNA polymerase Rpb6  83.93 
 
 		 59 aa  102  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2516  RNA polymerase Rpb6  79.31 
 
 		 58 aa  99.8  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.803203  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2597  RNA polymerase Rpb6  79.63 
 
 		 58 aa  96.3  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.533381  normal  0.132481 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1808  RNA polymerase Rpb6  60.38 
 
 		 55 aa  71.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.697543  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2894  RNA polymerase Rpb6  58.49 
 
 		 55 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.003737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2380  RNA polymerase Rpb6  54.9 
 
 		 56 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000413044  normal  0.621236 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2217  RNA polymerase Rpb6  53.57 
 
 		 57 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2392  DNA-directed RNA polymerase, subunit K  47.37 
 
 		 63 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000536412  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0479  RNA polymerase Rpb6  53.57 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1424  DNA-directed RNA polymerase, subunit K  52.63 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0159799 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1239  hypothetical protein  58.82 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0363462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0929  RNA polymerase Rpb6  52.73 
 
 		 57 aa  60.5  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1888  RNA polymerase Rpb6  47.46 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216577  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0290  RNA polymerase Rpb6  50 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.030804  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0266  RNA polymerase Rpb6  44.23 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0572  RNA polymerase Rpb6  44.23 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.624479  normal  0.168113 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0638  RNA polymerase Rpb6  42.31 
 
 		 56 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1346  RNA polymerase Rpb6  44.23 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.222064  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1093  RNA polymerase Rpb6  44.23 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1524  DNA-directed RNA polymerase subunit K  50.91 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.951161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8797  predicted protein  49.02 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.76808  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0502  DNA-directed RNA polymerase subunit K  47.27 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.982464  normal  0.408765 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10148  predicted protein  44 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313953  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02747  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III subunit Rpb6 (AFU_orthologue; AFUA_1G05160)  46 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0516525  normal  0.594971 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01770  DNA-directed RNA polymerases I, II, and III polypeptide, putative  44 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.201814  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60409  subunit common to RNA polymerases I, II, and III  44 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.7613 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0932  RNA polymerase Rpb6  49.02 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186024 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1772  DNA-directed RNA polymerase subunit K  45.45 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000021326 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1703  DNA-directed RNA polymerase subunit K  41.82 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.639739  normal  0.399247 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1673  DNA-directed RNA polymerase, subunit K  40.68 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0083987  normal  0.431934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>