More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4058 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007959  Nham_4058  transposase, mutator type  100 
 
 
424 aa  848    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0906986  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2785  transposase, mutator type  98.82 
 
 
424 aa  837    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2552  transposase, mutator type  55.56 
 
 
401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4637  transposase, mutator type  42.89 
 
 
449 aa  290  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4283  transposase, mutator type  42.65 
 
 
449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0829033  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4640  transposase, mutator type  44.82 
 
 
328 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0527  transposase  40.15 
 
 
434 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0132847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0604  transposase, mutator type  28.34 
 
 
439 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574476  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2066  transposase, mutator type  28.34 
 
 
439 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0791542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4741  transposase, mutator type  28.34 
 
 
439 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1631  transposase, mutator type  28.11 
 
 
415 aa  97.1  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2146  transposase, mutator type  28.11 
 
 
415 aa  97.1  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3201  transposase, mutator type  28.11 
 
 
415 aa  97.1  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5387  transposase, mutator type  28.39 
 
 
438 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294964  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5584  transposase, mutator type  29.57 
 
 
464 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334824  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0840  transposase, mutator type  29.18 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0937  transposase, mutator type  29.18 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336688  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1475  transposase, mutator type  29.18 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5433  transposase, mutator type  29.18 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5459  transposase, mutator type  29.18 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5830  transposase, mutator type  29.18 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5856  transposase, mutator type  29.18 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128333  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5450  transposase, mutator type  29.18 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790531  normal  0.0527916 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  26.3 
 
 
402 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  26.3 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  26.3 
 
 
402 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  26.3 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  26.3 
 
 
402 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  26.3 
 
 
402 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1439  transposase, mutator type  28.8 
 
 
434 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  26.23 
 
 
403 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06390  transposase  30.65 
 
 
426 aa  87.4  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00660  transposase  30.65 
 
 
426 aa  87.4  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2156  transposase, mutator type  26.25 
 
 
417 aa  87.4  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0191719  normal  0.0398782 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3955  transposase, mutator type  26.55 
 
 
417 aa  86.3  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2799  transposase, mutator type  26.55 
 
 
417 aa  86.3  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1453  hypothetical protein  27.81 
 
 
454 aa  83.2  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  26.37 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  26.37 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  26.37 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  26.37 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5521  transposase, mutator type  29.33 
 
 
469 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.380612 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5923  transposase, mutator type  29.33 
 
 
469 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383294  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  28.04 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  28.04 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  25.37 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  25.37 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  25.37 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1822  transposase  24.8 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1955  transposase  24.8 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  27.78 
 
 
419 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1721  transposase, mutator type  27.43 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3267  transposase, mutator type  26.63 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3986  transposase, mutator type  27.83 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0836  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.976413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1035  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000123113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1419  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1465  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1678  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1687  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4846  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01800  transposase  26.89 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0039  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0431  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668856  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0823  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0949  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1437  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.515564  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1488  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685723  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4917  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878139  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4934  transposase, mutator type  26.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166012  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2958  transposase, mutator type  27.47 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05430  transposase  27.82 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17950  transposase  27.82 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776929  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25830  transposase  27.82 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2672  transposase, mutator type  27.47 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0292  transposase, mutator type  27.47 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0587  transposase, mutator type  27.47 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0594  transposase, mutator type  27.47 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1889  transposase, mutator type  27.47 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2017  transposase, mutator type  27.47 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2201  transposase, mutator type  27.47 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2816  transposase, mutator type  27.47 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1998  transposase mutator type  22.85 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1330  ISAfe2, transposase  29.21 
 
 
420 aa  76.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.423267  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25910  transposase  27.57 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2013  transposase mutator type  23.74 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09270  transposase  26.44 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.681335  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00410  transposase, mutator family  27.01 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03110  transposase, mutator family  27.01 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.529932  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06560  transposase  26.44 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.796022 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12080  transposase, mutator family  27.01 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0258594  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12170  transposase, mutator family  27.01 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20590  transposase, mutator family  27.01 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00420  transposase, mutator family  27.01 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17620  transposase  26.44 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0181204  normal  0.508363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>