15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3282 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3282  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  347  8e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21610  hypothetical protein  47.55 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.281638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4496  hypothetical protein  31.55 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  0.0155475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1483  hypothetical protein  23.03 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000670899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  31.55 
 
 		 657 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0725  hypothetical protein  25.77 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.966908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1053  hypothetical protein  25 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0192  hypothetical protein  22.62 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657817  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0989  hypothetical protein  23.78 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0159  hypothetical protein  21.6 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0288442  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0098  hypothetical protein  26.97 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00649909  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1497  hypothetical protein  24.54 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2053  hypothetical protein  26.54 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1245  hypothetical protein  32.2 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.168393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2305  putative integral membrane protein  33.95 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>