15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2305 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2305  putative integral membrane protein  100 
 
 
167 aa  313  5e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4496  hypothetical protein  38.27 
 
 
183 aa  88.2  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  0.0155475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1245  hypothetical protein  43.48 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.168393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5215  hypothetical protein  34.19 
 
 
245 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00132012  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21610  hypothetical protein  30.07 
 
 
147 aa  48.5  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.281638  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0159  hypothetical protein  29.27 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0288442  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1517  hypothetical protein  36.79 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000419418  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1053  hypothetical protein  51.16 
 
 
166 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1497  hypothetical protein  27.34 
 
 
169 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0989  hypothetical protein  30.06 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1483  hypothetical protein  28.89 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000670899 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0061  hypothetical protein  44.9 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  30.85 
 
 
657 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0192  hypothetical protein  25 
 
 
201 aa  41.2  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657817  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1707  hypothetical protein  29.41 
 
 
168 aa  41.2  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>