15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2053 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2053  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4496  hypothetical protein  30.54 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  0.0155475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0192  hypothetical protein  34.65 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657817  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  30.77 
 
 		 657 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1245  hypothetical protein  30.67 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.168393 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0159  hypothetical protein  33.66 
 
 		 163 aa  54.7  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0288442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0989  hypothetical protein  31.68 
 
 		 165 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1053  hypothetical protein  32.35 
 
 		 166 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1483  hypothetical protein  31.68 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000670899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1497  hypothetical protein  31.73 
 
 		 169 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1517  hypothetical protein  29.25 
 
 		 167 aa  45.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000419418  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0061  hypothetical protein  29.9 
 
 		 182 aa  45.8  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5215  hypothetical protein  30.41 
 
 		 245 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00132012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1707  hypothetical protein  27.84 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0725  hypothetical protein  27.66 
 
 		 171 aa  42  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.966908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>