27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1102 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1102  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  644    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0101  hypothetical protein  58.39 
 
 
313 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170875  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1224  hypothetical protein  58.74 
 
 
313 aa  348  8e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3496  hypothetical protein  54.18 
 
 
315 aa  344  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2833  hypothetical protein  55.93 
 
 
294 aa  338  9e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000938747  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1866  hypothetical protein  53.31 
 
 
305 aa  323  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.786174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2080  hypothetical protein  53.33 
 
 
313 aa  320  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.246474  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1972  hypothetical protein  53.82 
 
 
298 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0722  hypothetical protein  52.84 
 
 
322 aa  311  5.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480992  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1804  hypothetical protein  51.66 
 
 
320 aa  309  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2490  hypothetical protein  48.84 
 
 
321 aa  301  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1470  hypothetical protein  48.68 
 
 
318 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0547  hypothetical protein  53.22 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.47713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2529  hypothetical protein  44.37 
 
 
337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158591  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0564  hypothetical protein  42.77 
 
 
314 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0561  hypothetical protein  45.75 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0532  hypothetical protein  42.49 
 
 
314 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4098  hypothetical protein  40.82 
 
 
319 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal  0.84222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2601  hypothetical protein  42 
 
 
313 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00160673  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0491  hypothetical protein  40.6 
 
 
303 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.106811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5413  hypothetical protein  40 
 
 
322 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8237  hypothetical protein  39.87 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1972  hypothetical protein  31.99 
 
 
307 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.238545 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1603  hypothetical protein  27.61 
 
 
298 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0178539  hitchhiker  0.0000000381472 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3033  hypothetical protein  28.77 
 
 
295 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00644621  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0048  hypothetical protein  54.35 
 
 
53 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0967  hypothetical protein  46.15 
 
 
114 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>