11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0465 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0465  putative cholesterol esterase  100 
 
 
215 aa  427  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.164836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2331  putative cholesterol esterase  64.77 
 
 
204 aa  266  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3021  hypothetical protein  45.13 
 
 
204 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00856166  normal  0.256259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0054  cholesterol esterase  45.85 
 
 
206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0214  cholesterol esterase  45.96 
 
 
203 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24697  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1278  putative cholesterol esterase  37.14 
 
 
220 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5976  cholesterol esterase  37.31 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0461  hypothetical protein  38.66 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.199487  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0136  PE-PGRS family protein  30.16 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0746  hypothetical protein  26.32 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3119  hypothetical protein  26.58 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>