14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0035 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0035  tRNA-Phe  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0033  tRNA-Phe  93.1 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0058  tRNA-Phe  90.48 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0017  tRNA-Phe  87.84 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0057  tRNA-Phe  90.2 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0046  tRNA-Phe  90 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0016  tRNA-Phe  89.8 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0056  tRNA-Phe  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.339254  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0045  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000428882  hitchhiker  0.00000000692947 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0047  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0721509  normal  0.0848173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0049  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0385641  normal  0.0854931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0051  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114614  normal  0.0557031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0053  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113148  normal  0.0557031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0055  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100813  normal  0.0566569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>