18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0033 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0033  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0035  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0016  tRNA-Phe  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0052  tRNA-Asn  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292372  normal  0.128808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37110  tRNA-Phe  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0860664  normal  0.0427609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0056  tRNA-Phe  86.79 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.339254  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0044  tRNA-Phe  85.71 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0017  tRNA-Phe  85.71 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0050  tRNA-Phe  85.71 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0013  tRNA-Phe  85.71 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0021  tRNA-Phe  85.71 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0045  tRNA-Phe  85.71 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0045  tRNA-Phe  85.71 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0048  tRNA-Phe  85.71 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0058  tRNA-Phe  87.04 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.764492  normal  0.700955 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0056  tRNA-Phe  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0504799  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0060  tRNA-Phe  87.04 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.223577  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0063  tRNA-Phe  87.04 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111891  normal  0.102996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>