14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0593 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0593  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  310  4.999999999999999e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0100  peptidase, zinc-dependent  27.07 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.92951  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1746  peptidase zinc-dependent  27.19 
 
 
180 aa  47.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0307  peptidase zinc-dependent  34.52 
 
 
173 aa  47  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0828  archaemetzincin-like protein  30.83 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.687512  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1602  archaemetzincin-like protein  29.21 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0329  archaemetzincin-like protein  34.52 
 
 
173 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0829  peptidase, zinc-dependent  28.83 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.435908  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2061  archaemetzincin-like protein  27.52 
 
 
156 aa  42.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1753  peptidase zinc-dependent  29.9 
 
 
175 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0006  Zn-dependent protease  27.88 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0006  peptidase zinc-dependent  27.88 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0334  archaemetzincin-like protein  32.58 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.567826  normal  0.0385783 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0006  peptidase zinc-dependent  27.96 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.655175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>