16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2908 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2908  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  200  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3617  hypothetical protein  44.58 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0737206 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2799  hypothetical protein  36.63 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325552  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0490  hypothetical protein  37.11 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.665895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2581  hypothetical protein  30.68 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0282387  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3197  hypothetical protein  36.26 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0546  heavy metal translocating P-type ATPase  34.25 
 
 		 766 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1382  hypothetical protein  24.36 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1384  hypothetical protein  24.71 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1210  hypothetical protein  31.25 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.279437 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0836  hypothetical protein  26.44 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.185102  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0357  hypothetical protein  28.24 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0491039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2577  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 698 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0984175  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22660  hypothetical protein  28.09 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155306  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2172  hypothetical protein  30.49 
 
 		 400 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.103435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2416  hypothetical protein  32.81 
 
 		 400 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>