12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2581 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2581  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0282387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22660  hypothetical protein  43.3 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155306  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3197  hypothetical protein  36.46 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0490  hypothetical protein  38.16 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.665895  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3617  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0737206 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2799  hypothetical protein  37.04 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325552  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2908  hypothetical protein  30.68 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0836  hypothetical protein  32.91 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.185102  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2362  hypothetical protein  28.12 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0928893  normal  0.122175 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1384  hypothetical protein  23.76 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0357  hypothetical protein  31.11 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0491039  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1382  hypothetical protein  25.61 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>