11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1807 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1807  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  791    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1366  conserved hypothetical protein  27.5 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04230  Cna B domain protein  35.85 
 
 		 609 aa  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0954  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1354 aa  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000910199  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0249  hypothetical protein  27.88 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.463551 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  31.34 
 
 		 1621 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1177  coiled-coil protein  27.72 
 
 		 243 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  31.71 
 
 		 746 aa  45.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1809  hypothetical protein  27.08 
 
 		 396 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.774525  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3898  chromosome segregation ATPases-like protein  29.33 
 
 		 777 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  30.87 
 
 		 545 aa  43.5  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>