15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0756 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0074  phosphoenolpyruvate carboxylase  65.17 
 
 		 511 aa  680    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.81242  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0756  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 509 aa  1032    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0335931 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1916  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.98 
 
 		 512 aa  538  1e-151  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0174  phosphoenolpyruvate carboxylase  43.2 
 
 		 492 aa  405  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.313607  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0773  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.28 
 
 		 489 aa  375  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.422074  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1694  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.46 
 
 		 504 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1798  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.67 
 
 		 507 aa  258  2e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2632  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.19 
 
 		 526 aa  183  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1157  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.25 
 
 		 537 aa  179  9e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00340367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1350  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.25 
 
 		 537 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00293216  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0252  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.04 
 
 		 461 aa  157  4e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.221918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0418  phosphoenolpyruvate carboxylase  28.94 
 
 		 461 aa  156  8e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1392  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.71 
 
 		 459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.256788 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1014  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.71 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.189328  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1265  phosphoenolpyruvate carboxylase  27.92 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>