15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2632 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2632  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 526 aa  1088    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1157  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.7 
 
 		 537 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00340367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1350  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.7 
 
 		 537 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00293216  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0252  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.42 
 
 		 461 aa  204  4e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.221918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1392  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.72 
 
 		 459 aa  203  5e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.256788 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1265  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.72 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1014  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.51 
 
 		 460 aa  201  3e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.189328  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1694  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.92 
 
 		 504 aa  201  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0418  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.72 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0376744 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0074  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.2 
 
 		 511 aa  193  6e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.81242  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1916  phosphoenolpyruvate carboxylase  28.54 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0756  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.18 
 
 		 509 aa  182  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0335931 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1798  phosphoenolpyruvate carboxylase  27.53 
 
 		 507 aa  179  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0174  phosphoenolpyruvate carboxylase  28.47 
 
 		 492 aa  163  9e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.313607  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0773  phosphoenolpyruvate carboxylase  28.44 
 
 		 489 aa  141  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.422074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>