15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1350 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1350  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 537 aa  1102    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00293216  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1157  phosphoenolpyruvate carboxylase  98.88 
 
 		 537 aa  1088    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00340367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2632  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.7 
 
 		 526 aa  301  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0074  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.2 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.81242  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1694  phosphoenolpyruvate carboxylase  27.53 
 
 		 504 aa  177  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0756  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.25 
 
 		 509 aa  177  6e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0335931 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1798  phosphoenolpyruvate carboxylase  26.11 
 
 		 507 aa  176  8e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1014  phosphoenolpyruvate carboxylase  27.11 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.189328  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1916  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.75 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0418  phosphoenolpyruvate carboxylase  28.03 
 
 		 461 aa  166  9e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1392  phosphoenolpyruvate carboxylase  27.69 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.256788 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0252  phosphoenolpyruvate carboxylase  27.74 
 
 		 461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.221918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1265  phosphoenolpyruvate carboxylase  26.75 
 
 		 464 aa  162  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0773  phosphoenolpyruvate carboxylase  27.86 
 
 		 489 aa  130  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.422074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0174  phosphoenolpyruvate carboxylase  27.58 
 
 		 492 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.313607  normal  0.772368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>